染色體的三維結(jié)構(gòu)指的是染色體在空間中的組織方式和構(gòu)象，它對(duì)于基因表達(dá)調(diào)控和細(xì)胞功能至關(guān)重要。染色體通常被認(rèn)為是一條線性的 DNA 分子，但在細(xì)胞核中，它們呈現(xiàn)出復(fù)雜的折疊和組織形式，形成了一種高度有序的三維結(jié)構(gòu)。

染色體的三維結(jié)構(gòu)對(duì)細(xì)胞內(nèi)基因表達(dá)的調(diào)控起著關(guān)鍵作用。通過(guò)調(diào)控染色體上不同區(qū)域之間的距離和相互作用，細(xì)胞可以精確地控制基因的轉(zhuǎn)錄和沉默。此外，染色體的三維結(jié)構(gòu)還影響 DNA 復(fù)制、修復(fù)和重組等重要的細(xì)胞過(guò)程。

染色體的三維結(jié)構(gòu)對(duì)于理解基因組的功能和調(diào)控至關(guān)重要。通過(guò)技術(shù)如染色體構(gòu)象捕獲和單細(xì)胞染色體構(gòu)象分析，科學(xué)家們能夠揭示染色體在空間中的組織方式，以及基因之間的相互作用。這有助于我們更深入地了解基因表達(dá)調(diào)控、染色體異常和疾病發(fā)生的機(jī)制。

Arima Hi-C 是一種高通量測(cè)序技術(shù)，用于研究染色體的三維結(jié)構(gòu)。其原理基于染色體構(gòu)象捕獲（chromosome conformation capture，3C）技術(shù)的擴(kuò)展。其核心是鄰近連接，即通過(guò)交聯(lián)核 DNA、用限制性酶消化、生物素標(biāo)記，并在使用標(biāo)準(zhǔn) NGS 方法進(jìn)行測(cè)序之前進(jìn)行鄰近連接。這使您可以在一次檢測(cè)中捕獲關(guān)鍵的三維基因組組織和長(zhǎng)距離遺傳信息。

1. Cross-linking（交聯(lián)）：首先，細(xì)胞中的染色體被交聯(lián)，使得距離較近的染色體區(qū)域之間形成交聯(lián)。這可以通過(guò)使用染色體交聯(lián)劑（cross-linking agent）如福爾馬林來(lái)實(shí)現(xiàn)。

2. Digestion（消化）：然后，染色體被酶消化，將交聯(lián)的染色體切割成小片段。這樣做可以保留交聯(lián)的區(qū)域，同時(shí)消除其余的連接。

3. DNA端連接（Ligation）：接下來(lái)，利用連接酶（ligase）將距離較近的交聯(lián)片段的DNA末端連接起來(lái)，形成一個(gè)連接的染色體分子。

4. 逆交聯(lián)（De-crosslinking）：之后，通過(guò)逆轉(zhuǎn)交聯(lián)，將交聯(lián)的染色體分子恢復(fù)為單個(gè)DNA鏈。

5. 測(cè)序（Sequencing）：最后，對(duì)連接的DNA進(jìn)行高通量測(cè)序，得到染色體上各個(gè)區(qū)域之間的相互作用頻率。

Arima Genomics 的 Hi-C 產(chǎn)品具有以下特點(diǎn)：

1. 高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)：Arima Genomics 的 Hi-C 產(chǎn)品提供高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)，能夠捕獲染色體間和染色體內(nèi)的相互作用，從而提供詳細(xì)的染色體三維結(jié)構(gòu)信息。

2. 全基因組覆蓋：其產(chǎn)品覆蓋全基因組范圍，能夠?qū)θ旧w上的各個(gè)區(qū)域之間的相互作用進(jìn)行全面的分析。

3. 優(yōu)化的實(shí)驗(yàn)流程：Arima Genomics 提供了優(yōu)化的實(shí)驗(yàn)流程和試劑盒，簡(jiǎn)化了 Hi-C 實(shí)驗(yàn)的操作步驟，提高了實(shí)驗(yàn)效率和可重復(fù)性。

4. 專業(yè)的生物信息學(xué)分析支持：除了提供實(shí)驗(yàn)試劑盒，Arima Genomics 還提供了專業(yè)的生物信息學(xué)分析支持，幫助研究人員對(duì) Hi-C 數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和解釋。

Arima Genomics 成立于2015年，專注于開(kāi)發(fā)高通量測(cè)序技術(shù)以及生物信息學(xué)分析工具，其 Hi-C 產(chǎn)品在染色體三維結(jié)構(gòu)研究領(lǐng)域備受關(guān)注。Arima的目標(biāo)是通過(guò)3D基因組的力量推進(jìn)生命科學(xué)，促進(jìn)對(duì)基因組順序和結(jié)構(gòu)及其對(duì)人類健康、疾病、物種演化作用的理解。